Características de la Unidad

La Unidad de Genómica (UG) es una Unidad diseñada para la generación de nuevo conocimiento, productos y servicios en el área de la biología molecular, genómica, proteómica y biología celular, utilizando novedosas tecnologías, en un ambiente amigable, ético y de alta calidad para el área de la salud e industrias agro-alimentarias y farmacéuticas y busca ser líder en desarrollos basados en estudios de ácidos nucleicos y proteínas.

 

Cuenta con plataformas para Secuenciación de Nueva Generación (NGS), microarreglos de ácidos nucleicos, proteómica, PCR en tiempo real y cultivo celular. Además, cuenta con las instalaciones adecuadas para realizar diagnóstico molecular en el área de la salud, agronomía, veterinaria y biotecnología en general. Puede apoyar y dar entrenamiento a otros centros y/o investigadores en la aplicación de herramientas genómicas.

Responsable de la Unidad

Q.C.B Patricia Villarreal Quiroga

Correo Electrónico: patricia.villarrealq@uanl.mx

Teléfono: +52(81) 1340 4370 a la extensión 1724, 1718 o 1716

La amplia colección de pruebas y plataformas de genética y proteómica que ofrece la Unidad de Genómica brinda a pacientes y médicos las soluciones para un diagnóstico de certeza, y a investigadores opciones para desarrollar sus proyectos con calidad en diseño experimental y análisis de datos.

 

 

  • Microarreglos
    • Genotipificación (SNP’s, CNV’s)
    • Expresión génica
    • MicroRNA’s
    • Metabolismo de drogas (DMET)

 

  • Secuenciación de nueva generación
    • Secuenciación de genomas pequeños
    • Transcriptoma
    • Metagenómica
    • Farmacogenómica
    • Paneles de genes asociados a cáncer
    • Paneles de genes personalizados

 

  • PCR punto final y tiempo real (qPCR)
    • Cuantificación absoluta
    • Cuantificación relativa
    • Discriminación alélica
    • Análisis de CNV’s

 

  • Diagnóstico Molecular
    • Detección de patógenos
    • Detección de mutaciones y variantes genéticas (SNP’s)

 

  • Cultivo celular
    • Mantenimiento y expansión de diversas líneas celulares
    • Ensayos de apoptosis, diferenciación, invasión, migración y adipogénesis
    • Ensayos de cultivo en 3D
    • Ensayos de nuevas moléculas en modelos in vitro (líneas celulares) e in vivo (modelo murino)
    • Ensayos de viabilidad y toxicidad en modelo de hipoxia y acidez

 

  • Proteómica
    • Extracción y cuantificación de proteínas
    • Electroforesis bidimensional
    • Western Blot
    • Identificación de proteínas por Espectrometría de masas
    • SDS-PAGE

  • Microarreglos
    • Plataforma Affymetrix
    • Plataforma NimbleGen
  • Secuenciación
    • MiSeq illumina
  • PCR
    • GeneAmp 9700
    • Veriti 9902
    • Tetrad 2
    • MasterCycler
    • GeneAmp 2400
  • PCR tiempo real
    • Light Cycler 480 II
  • Proteómica
    • GelDoc XR
    • ChemiDoc XRS
    • Exquest /spot cutter
  • Cultivo Celular
    • Incubadora CO2
    • Cabina de Bioseguridad Clase II A2
    • Microscopio
    • Microscopio invertido
    • Microscopio de fluorescencia
    • Luminómetro de placas
    • Cámara de hipoxia
    • Tanque criogénico
  • Otros
    • Bioanalizador 2100
    • NanoDrop 8000
    • Espectrofotómetro Smart Plus

Termo-shaker orbital

  1. Delgado-Suárez, E. J., Selem-Mojica, N., Ortiz-López, R., Gebreyes, W. A., Allard, M. W., Barona-Gómez, F., & Rubio-Lozano, M. S. (2018). Whole genome sequencing reveals widespread distribution of typhoidal toxin genes and VirB/D4 plasmids in bovine-associated nontyphoidal Salmonella. Scientific Reports, 8(1), 9864. http://doi.org/10.1038/s41598-018-28169-4

 

  1. Calvo-Anguiano, G., Lugo-Trampe, J. J., Camacho, A., Said-Fernández, S., Mercado-Hernández, R., Zomosa-Signoret, V., Ortiz-López, R. (2018). Comparison of specific expression profile in two in vitro hypoxia models. Experimental and Therapeutic Medicine, 15(6), 4777–4784. http://doi.org/10.3892/etm.2018.6048

 

  1. Camacho, A., Segoviano-Ramírez, J. C., Sánchez-Garcia, A., de Jesus Herrera-de la Rosa, J., García-Juarez, J., Hernandez-Puente, C. A., Ortiz-Lopez, R. (2018). Tyrphostin AG17 inhibits adipocyte differentiation in vivo and in vitro. Lipids in Health and Disease, 17(1), 128. http://doi.org/10.1186/s12944-018-0784-7

 

  1. Martinez-Jacobo, L.,Ancer-Arellano, C. I., Ortiz-Lopez, R., Salinas-Santander, M., Villarreal-Villarreal, C. D., Ancer-Rodriguez, Camacho-Zamora,  B., Zomosa-Signoret V., Medina-De la Garza C.E., Ocampo-Candiani J,  Rojas-Martinez, A. (2018). Evaluation of the Expression of Genes Associated with Inflammation and Apoptosis in Androgenetic Alopecia by Targeted RNA-Seq. Skin Appendage Disorders, 4(4), 268–273. http://doi.org/10.1159/000484530

 

  1. Manuel Vazquez-Guillen, J., Palacios-Saucedo, G. C., Guadalupe Rivera-Morales, L., Valeria Alonzo-Morado, M., Berenice Burciaga-Bernal, S., Montufar-Martinez, M., Rodriguez-Padilla, C. (2018). Infection and coinfection by human papillomavirus, Epstein-Barr virus and Merkel cell polyomavirus in patients with squamous cell carcinoma of the larynx: a retrospective study. http://doi.org/10.7717/peerj.5834

 

  1. Salinas-Santander, M., Trevino, V., de la Rosa-Moreno, E., Verduzco-Garza, B., Sánchez-Domínguez, C. N., Cantú-Salinas, C., Ortiz-López, R. (2018). CAPN3, DCT, MLANA and TYRP1 are overexpressed in skin of vitiligo vulgaris Mexican patients. Experimental and Therapeutic Medicine. http://doi.org/10.3892/etm.2018.5764

 

  1. Sánchez‑García, A., Cabral‑Pacheco, G., Zomosa‑Signoret, V., Ortiz‑López, R., Camacho, A., Tabera‑Tarello, P., Vidal tamayo, R. (2017). Modular organization of a hypocretin gene minimal promoter. Molecular Medicine Reports, 17(2), 2263–2270. http://doi.org/10.3892/mmr.2017.8142

QCB. Patricia Villarreal Quiroga

 

Juanita González Domínguez

 

TSU. Carlos Alberto Hernández Puente

 

QBP. Laura Rivera Narváez

 

Daniel Matta Yee Chig

  • Licenciado en Biotecnología Genómica. Facultad de Ciencias Biológicas. UANL.
  • Maestro en Ciencias con Orientación en Morfología. Facultad de Medicina, UANL.

 

Luis Ernesto Osuna Rosales

  • Licenciado en Biotecnología Genómica. Facultad de Ciencias Biológicas. UANL.
  • Maestro en Ciencias con Orientación en Biotecnología y Ecología

 

Bianka Dianey Camacho Zamora

  • Ingeniero en Biotecnología, Universidad Politécnica de Sinaloa.
  • Maestra en Ciencias con Orientación en Biología Molecular e Ingeniería Genética, Facultad de Medicina, UANL.

 

Estudiantes de Pregrado

  • María Luisa Sánchez. Licenciado en Biotecnología Genómica.
  • María Fernanda Sánchez Lomas. Licenciado en Biotecnología Genómica.
  • José Roberto Trejo Treviño. Médico Cirujano Partero.

Estudiante de Posgrado

  • C.P. Ana Cecilia Lamadrid Zertuche. Especialidad en Dermatología. UANL.
  • “Determinación de microbiomas en muestras provenientes del mar de Cortés”.

 

  • “Secuenciación de genomas bacterianos en pacientes con infecciones vaginales”.

 

  • “Identificación de variantes genéticas relacionadas al desarrollo de cáncer colorrectal”

 

  • “Expresión de caspasas y otros genes de apoptosis en pacientes masculinos con alopecia androgenética y su correlación con niveles de testosterona y DHT en sangre periférica”.

 

  • “Papel del factor de transcripción FOXC1 en la Transición Epitelial-Mesenquimal en cáncer de mama”.

 

  • “Identificación de posibles genes blanco de FOXC1 en líneas celulares de cáncer de mama”.

 

  • “Caracterización in vitro de perfiles proteicos de las líneas celulares MCF7 y MCF12A”

 

  • “Uso de la técnica 2D-PAGE para el análisis proteómico comparativo entre las líneas celulares de cáncer de mama BT474 y HCC1954”.
Servicios

La amplia colección de pruebas y plataformas de genética y proteómica que ofrece la Unidad de Genómica brinda a pacientes y médicos las soluciones para un diagnóstico de certeza, y a investigadores opciones para desarrollar sus proyectos con calidad en diseño experimental y análisis de datos.

 

 

  • Microarreglos
    • Genotipificación (SNP’s, CNV’s)
    • Expresión génica
    • MicroRNA’s
    • Metabolismo de drogas (DMET)

 

  • Secuenciación de nueva generación
    • Secuenciación de genomas pequeños
    • Transcriptoma
    • Metagenómica
    • Farmacogenómica
    • Paneles de genes asociados a cáncer
    • Paneles de genes personalizados

 

  • PCR punto final y tiempo real (qPCR)
    • Cuantificación absoluta
    • Cuantificación relativa
    • Discriminación alélica
    • Análisis de CNV’s

 

  • Diagnóstico Molecular
    • Detección de patógenos
    • Detección de mutaciones y variantes genéticas (SNP’s)

 

  • Cultivo celular
    • Mantenimiento y expansión de diversas líneas celulares
    • Ensayos de apoptosis, diferenciación, invasión, migración y adipogénesis
    • Ensayos de cultivo en 3D
    • Ensayos de nuevas moléculas en modelos in vitro (líneas celulares) e in vivo (modelo murino)
    • Ensayos de viabilidad y toxicidad en modelo de hipoxia y acidez

 

  • Proteómica
    • Extracción y cuantificación de proteínas
    • Electroforesis bidimensional
    • Western Blot
    • Identificación de proteínas por Espectrometría de masas
    • SDS-PAGE

Infraestructura
  • Microarreglos
    • Plataforma Affymetrix
    • Plataforma NimbleGen
  • Secuenciación
    • MiSeq illumina
  • PCR
    • GeneAmp 9700
    • Veriti 9902
    • Tetrad 2
    • MasterCycler
    • GeneAmp 2400
  • PCR tiempo real
    • Light Cycler 480 II
  • Proteómica
    • GelDoc XR
    • ChemiDoc XRS
    • Exquest /spot cutter
  • Cultivo Celular
    • Incubadora CO2
    • Cabina de Bioseguridad Clase II A2
    • Microscopio
    • Microscopio invertido
    • Microscopio de fluorescencia
    • Luminómetro de placas
    • Cámara de hipoxia
    • Tanque criogénico
  • Otros
    • Bioanalizador 2100
    • NanoDrop 8000
    • Espectrofotómetro Smart Plus

Termo-shaker orbital

Publicaciones
  1. Delgado-Suárez, E. J., Selem-Mojica, N., Ortiz-López, R., Gebreyes, W. A., Allard, M. W., Barona-Gómez, F., & Rubio-Lozano, M. S. (2018). Whole genome sequencing reveals widespread distribution of typhoidal toxin genes and VirB/D4 plasmids in bovine-associated nontyphoidal Salmonella. Scientific Reports, 8(1), 9864. http://doi.org/10.1038/s41598-018-28169-4

 

  1. Calvo-Anguiano, G., Lugo-Trampe, J. J., Camacho, A., Said-Fernández, S., Mercado-Hernández, R., Zomosa-Signoret, V., Ortiz-López, R. (2018). Comparison of specific expression profile in two in vitro hypoxia models. Experimental and Therapeutic Medicine, 15(6), 4777–4784. http://doi.org/10.3892/etm.2018.6048

 

  1. Camacho, A., Segoviano-Ramírez, J. C., Sánchez-Garcia, A., de Jesus Herrera-de la Rosa, J., García-Juarez, J., Hernandez-Puente, C. A., Ortiz-Lopez, R. (2018). Tyrphostin AG17 inhibits adipocyte differentiation in vivo and in vitro. Lipids in Health and Disease, 17(1), 128. http://doi.org/10.1186/s12944-018-0784-7

 

  1. Martinez-Jacobo, L.,Ancer-Arellano, C. I., Ortiz-Lopez, R., Salinas-Santander, M., Villarreal-Villarreal, C. D., Ancer-Rodriguez, Camacho-Zamora,  B., Zomosa-Signoret V., Medina-De la Garza C.E., Ocampo-Candiani J,  Rojas-Martinez, A. (2018). Evaluation of the Expression of Genes Associated with Inflammation and Apoptosis in Androgenetic Alopecia by Targeted RNA-Seq. Skin Appendage Disorders, 4(4), 268–273. http://doi.org/10.1159/000484530

 

  1. Manuel Vazquez-Guillen, J., Palacios-Saucedo, G. C., Guadalupe Rivera-Morales, L., Valeria Alonzo-Morado, M., Berenice Burciaga-Bernal, S., Montufar-Martinez, M., Rodriguez-Padilla, C. (2018). Infection and coinfection by human papillomavirus, Epstein-Barr virus and Merkel cell polyomavirus in patients with squamous cell carcinoma of the larynx: a retrospective study. http://doi.org/10.7717/peerj.5834

 

  1. Salinas-Santander, M., Trevino, V., de la Rosa-Moreno, E., Verduzco-Garza, B., Sánchez-Domínguez, C. N., Cantú-Salinas, C., Ortiz-López, R. (2018). CAPN3, DCT, MLANA and TYRP1 are overexpressed in skin of vitiligo vulgaris Mexican patients. Experimental and Therapeutic Medicine. http://doi.org/10.3892/etm.2018.5764

 

  1. Sánchez‑García, A., Cabral‑Pacheco, G., Zomosa‑Signoret, V., Ortiz‑López, R., Camacho, A., Tabera‑Tarello, P., Vidal tamayo, R. (2017). Modular organization of a hypocretin gene minimal promoter. Molecular Medicine Reports, 17(2), 2263–2270. http://doi.org/10.3892/mmr.2017.8142
Personal

QCB. Patricia Villarreal Quiroga

 

Juanita González Domínguez

 

TSU. Carlos Alberto Hernández Puente

 

QBP. Laura Rivera Narváez

 

Daniel Matta Yee Chig

  • Licenciado en Biotecnología Genómica. Facultad de Ciencias Biológicas. UANL.
  • Maestro en Ciencias con Orientación en Morfología. Facultad de Medicina, UANL.

 

Luis Ernesto Osuna Rosales

  • Licenciado en Biotecnología Genómica. Facultad de Ciencias Biológicas. UANL.
  • Maestro en Ciencias con Orientación en Biotecnología y Ecología

 

Bianka Dianey Camacho Zamora

  • Ingeniero en Biotecnología, Universidad Politécnica de Sinaloa.
  • Maestra en Ciencias con Orientación en Biología Molecular e Ingeniería Genética, Facultad de Medicina, UANL.

 

Estudiantes de Pregrado

  • María Luisa Sánchez. Licenciado en Biotecnología Genómica.
  • María Fernanda Sánchez Lomas. Licenciado en Biotecnología Genómica.
  • José Roberto Trejo Treviño. Médico Cirujano Partero.

Estudiante de Posgrado

  • C.P. Ana Cecilia Lamadrid Zertuche. Especialidad en Dermatología. UANL.
Proyectos de Investigación
  • “Determinación de microbiomas en muestras provenientes del mar de Cortés”.

 

  • “Secuenciación de genomas bacterianos en pacientes con infecciones vaginales”.

 

  • “Identificación de variantes genéticas relacionadas al desarrollo de cáncer colorrectal”

 

  • “Expresión de caspasas y otros genes de apoptosis en pacientes masculinos con alopecia androgenética y su correlación con niveles de testosterona y DHT en sangre periférica”.

 

  • “Papel del factor de transcripción FOXC1 en la Transición Epitelial-Mesenquimal en cáncer de mama”.

 

  • “Identificación de posibles genes blanco de FOXC1 en líneas celulares de cáncer de mama”.

 

  • “Caracterización in vitro de perfiles proteicos de las líneas celulares MCF7 y MCF12A”

 

  • “Uso de la técnica 2D-PAGE para el análisis proteómico comparativo entre las líneas celulares de cáncer de mama BT474 y HCC1954”.