Características de la Unidad

La Unidad de Genómica (UG) es una Unidad diseñada para la generación de nuevo conocimiento, productos y servicios en el área de la biología molecular, genómica, proteómica y biología celular, utilizando novedosas tecnologías, en un ambiente amigable, ético y de alta calidad para el área de la salud e industrias agro-alimentarias y farmacéuticas y busca ser líder en desarrollos basados en estudios de ácidos nucleicos y proteínas.

 

Cuenta con plataformas para Secuenciación de Nueva Generación (NGS), microarreglos de ácidos nucleicos, Proteómica, PCR en tiempo real y cultivo celular. Además, cuenta con las instalaciones adecuadas para realizar diagnóstico molecular en el área de la salud, agronomía, veterinaria y biotecnología en general. Puede apoyar y dar entrenamiento a otros centros y/o investigadores en la aplicación de herramientas genómicas.

En los últimos años, la Unidad de Genómica ha implementado una batería de estudios en modelos preclínicos (cultivo de células y ratón) que ayudan a la valoración de la DL50, toxicidad y efecto funcional de algu

nas moléculas que tienen aplicación clínica.

Responsable de la Unidad

Q.C.B Patricia Villarreal Quiroga

Correo Electrónico: patricia.villarrealq@uanl.mx

Teléfono: +52(81) 1340 4370 a la extensión 1724, 1718 o 1716

  • Microarreglos
    • Genotipificación (SNP’s, CNV’s)
    • Expresión génica
    • MicroRNA’s
    • Metabolismo de drogas (DMET)
    • Citogenética molecular
  • Secuenciación de nueva generación
    • Secuenciación de genomas pequeños
    • Transcriptoma
    • Metagenómica
    • Farmacogenómica
    • Paneles de genes asociados a cáncer
    • Paneles de genes personalizados
  • PCR punto final y tiempo real (qPCR)
    • Cuantificación absoluta
    • Cuantificación relativa
    • Discriminación alélica
    • Análisis de CNV’s
  • Cultivo celular
    • Mantenimiento y expansión de diversas líneas celulares
    • Ensayos de apoptosis, diferenciación, invasión, migración y adipogénesis
    • Ensayos de cultivo en 3D
    • Ensayos de nuevas moléculas en modelos in vitro (líneas celulares) e in vivo (modelo murino)
    • Ensayos de viabilidad y toxicidad en modelo de hipoxia y acidez
  • Diagnóstico Molecular
    • Detección de patógenos(virus y bacterias)
    • Detección de mutaciones y variantes genéticas (SNP’s)
    • Citogenética Molecular
    • FISH para diversos blancos
  • Proteómica
    • Electroforesis bidimensional
    • Extracción y cuantificación de proteínas
    • Western Blot
    • Identificación de proteínas por Espectrometría de masas
    • SDS-PAGE
  • Microarreglos
    • Plataforma Affymetrix
    • Plataforma NimbleGen
  • Secuenciación
    • MiSeq illumina
  • PCR
    • GeneAmp 9700
    • Veriti 9902
    • Tetrad 2
    • MasterCycler
    • GeneAmp 2400
  • PCR tiempo real
    • Light Cycler 480 II
  • Proteómica
    • GelDoc XR
    • ChemiDoc XRS
    • Exquest /spot cutter
  • Cultivo Celular
    • Incubadora CO2
    • Cabina de Bioseguridad Clase II A2
    • Microscopio
    • Microscopio invertido
    • Microscopio de fluorescencia
    • Luminómetro de placas
    • Cámara de hipoxia
    • Tanque criogénico
  • Otros
    • Experion (estación de electroforesis)
    • Bioanalizador 2100
    • NanoDrop 8000
    • Espectrofotómetro Smart Plus
    • Termo-shaker orbital
  • Enviados: E1. BMC Cancer / # BCAN-D-15-00838 Gene expression signature of TNBC vs nTNBC highlights biomarkers involved in cell metabolism Sandra Karina Santuario-Facio; Servando Cardona-Huerta; Yadira Xitlalli Perez-Paramo; Victor Trevino; Francisco Hernandez-Cabrera; Augusto Rojas-Martinez; Lizeth Martinez-Jacobo; Gerardo Padilla-Rivas; Gerardo Muñoz-Maldonado; Jorge Luis Martinez-Rodriguez; Juan F. Gonzalez-Guerrero; Javier Valero-Gomez; Ana L. Vazquez-Guerrero; Herminia Guadalupe Martinez-Rodriguez; Alvaro Barboza-Quintana; Raquel Garza-Guajardo; Oralia Barboza-Quintana; Rocio Ortiz-Lopez, Ph. D. (corresponding)E2.  Ciencia UANL. Adriana Sánchez-García, Viviana C. Zomosa-Signoret, RocíoOrtiz-López and Román Vidaltamayo. Orexina y sus Aplicaciones en la Clínica.E3: Frontiers in Molecular Neuroscience Adriana Sánchez-García*, Rocío Ortiz-López*,**, Viviana Chantal Zomosa-Signoret*, Román Vidaltamayo***The Transcription Factor ebf2 Activates Gene Expression Driven by a Hypocretin Minimal Promoter Region (Ebf2 increases orexin-promoter driven expression)
  • Publicaciones más recientes
    1. Sevilla González FK, Welsh Lozano O, Ortiz López R, Vera Cabrera L, Ocampo Candiani J, Zamora Avila DE, Ocampo Garza J, Hernández Escareño JJ. “Distribution of Malassezia species in Mexican seborrheic dermatitis patients” ACEPTADO. African Journal of Microbiology Research 2016. ISSN 1996-0808.
    1. Mauricio A. Salinas-Santander1, Elizabeth Bazan-Mendoza2, Marisol Espinosa-Ruiz2, Rocio Ortiz-Lopez3,4, Adriana Bustamante5, Celia Sanchez-Domínguez. The +1858 C/T polymorphism in the PTPN22 gene is associated to Cystic Fibrosis patients in Northeast Mexico. Running title: PTPN22 polymorphism in Mexican patients with CF. ACEPTADO. Archives of Medical Research / # ARCMED-D-16-00145
    1. Antonio Ali Perez-Maya, Rosa Maria Hinojosa-Robles, Jose Ramon Barcenas-Walls, Armando Vignau-Cantu, Hugo A. Barrera-Saldaña, Rocio Ortiz-Lopez. Complete Genome Sequence of Streptococcus pneumoniae Serotype 19A, a Blood Clinical Isolate from Northeast Mexico. ACEPTADO. Genome Announcement March/April 2016 4(2) e00195-16
    1. Cuervo-Sierra J, Jaime-Pérez JC, Martínez-Hernández RA, García-Sepúlveda RD, Sánchez-Cárdenas M, Gómez-Almaguer D, Ortíz-López R, Villarreal-Villarreal CD, Ruiz-Arguelles GJ, Ruiz-Delgado G, LutzPresno J, Garcés-Eisele J, Ignacio-Ibarra G, Muciño-Hernández G, Arana-Trejo RM, Jiménez-Mejia AM, Vásquez-Palacio G. Prevalence and Clinical Significance of FLT3 Mutation Status in Acute Myeloid Leukemia Patients: A Multicenter Study. Arch Med Res. 2016. 47(3):172-9.
    2. Gonzalez-Carrillo C, Millan-Sauceda C, Lozano-Garza HG, Ortiz-Lopez R, Elizondo-Gonzalez R, Welsh O, Ocampo-Candiani J, Vera-Cabrera L. Genomic Changes Associated with the Loss of Nocardia brasiliensis Virulence in Mice after 200 In Vitro Passages. Infect Immun. 2016. 19;84(9):2595-606.

QCB. Patricia Villarreal Quiroga

QBP. Laura Rivera Narváez

MC. Luis Ernesto Osuna Rosales

TSU. Carlos Alberto Hernández Puente

Juanita González Domínguez

 

M.C. Lizeth Alejandra Martínez Jacobo.

  • Químico Clínico Biólogo, Facultad de Medicina, UANL.
  • Maestría en Ciencias con Orientación en Biología Molecular e Ingeniería Genética, Facultad de Medicina, UANL.
  • Candidato a Doctora en Ciencias con Orientación en Biología Molecular e Ingeniería Genética, Facultad de Medicina, UANL.
  • Certificado en Genética Médica por Universitat de València, València, España
  • Miembro del Colegio Mexicano para el Estudio y Tratamiento de los Defectos Congénitos.
    • Áreas de investigación
      • Análisis multiómico de la alopecia androgenética.
      • Identificación de alteraciones genómicas en pacientes con defectos congénitos y retraso en el desarrollo/discapacidad intelectual de etiología desconocida.
    • Proyectos
      • Identificación de alteraciones genómicas en pacientes con defectos congénitos y retraso en el desarrollo/discapacidad intelectual de etiología desconocida.
      • “Correlación de la expresión de GPR44, PTGDS y PGE2 con el nivel de testosterona total y fracción libre en sangre periférica de pacientes masculinos y femeninos con alopecia androgenética”. M.C.P. César Daniel Villarreal.
      • “Expresión de caspasas y otros genes de apoptosis en pacientes masculinos con alopecia androgenética y su correlación con niveles de testosterona y DHT en sangre periférica”. M.C.P. Ana Cecilia Lamadrid Zertuche.
      • “Efecto de la suplementación dietética con flavonoides durante la gestación y lactancia en ratas Wistar madres y su papel en la prevención de obesidad en la descendencia”. L.N. Carolina Treviño De Alba.

 

IBT. Bianka Dianey Camacho Zamora

  • Ingeniero en Biotecnología, Universidad Politécnica de Sinaloa.
  • Candidata a Maestra en Ciencias con Orientación en Biología Molecular e Ingeniería Genética, Facultad de Medicina, UANL.
    • Áreas de investigación
      • Análisis del papel de FOXC1 en la Transición Epitelial-Mesenquimal en cáncer de mama.
      • Caracterización proteómica de subtipos moleculares de cáncer de mama.
    • Proyectos de Investigación
      • “Papel del factor de transcripción FOXC1 en la Transición Epitelial-Mesenquimal en cáncer de mama”.
      • “Identificación de posibles genes blanco de FOXC1 en líneas celulares de cáncer de mama”. Ana Victoria Camero Maldonado.
      • “Caracterización in vitro de perfiles proteicos de las líneas celulares MCF7 y MCF12A” . José Mauricio Ayala Esparza.
      • “Perfil proteómico comparativo entre las líneas celulares HCC1395 y MDAMB231” Tania Melissa López Pérez.
      • “Uso de la técnica 2D-PAGE para el análisis proteómico comparativo entre las líneas celulares de cáncer de mama BT474 y HCC1954”. Norma Paola Guízar Amador.

 

Estudiantes de Pregrado (Asesoría)

  • José Mauricio Ayala Esparza. Licenciado en Biotecnología Genómica.
  • Norma Paola Guízar Amador. Licenciado en Biotecnología Genómica.
  • Tania Melissa López Pérez. Químico Bacteriólogo Parasitólogo.
Servicios
  • Microarreglos
    • Genotipificación (SNP’s, CNV’s)
    • Expresión génica
    • MicroRNA’s
    • Metabolismo de drogas (DMET)
    • Citogenética molecular
  • Secuenciación de nueva generación
    • Secuenciación de genomas pequeños
    • Transcriptoma
    • Metagenómica
    • Farmacogenómica
    • Paneles de genes asociados a cáncer
    • Paneles de genes personalizados
  • PCR punto final y tiempo real (qPCR)
    • Cuantificación absoluta
    • Cuantificación relativa
    • Discriminación alélica
    • Análisis de CNV’s
  • Cultivo celular
    • Mantenimiento y expansión de diversas líneas celulares
    • Ensayos de apoptosis, diferenciación, invasión, migración y adipogénesis
    • Ensayos de cultivo en 3D
    • Ensayos de nuevas moléculas en modelos in vitro (líneas celulares) e in vivo (modelo murino)
    • Ensayos de viabilidad y toxicidad en modelo de hipoxia y acidez
  • Diagnóstico Molecular
    • Detección de patógenos(virus y bacterias)
    • Detección de mutaciones y variantes genéticas (SNP’s)
    • Citogenética Molecular
    • FISH para diversos blancos
  • Proteómica
    • Electroforesis bidimensional
    • Extracción y cuantificación de proteínas
    • Western Blot
    • Identificación de proteínas por Espectrometría de masas
    • SDS-PAGE
Infraestructura
  • Microarreglos
    • Plataforma Affymetrix
    • Plataforma NimbleGen
  • Secuenciación
    • MiSeq illumina
  • PCR
    • GeneAmp 9700
    • Veriti 9902
    • Tetrad 2
    • MasterCycler
    • GeneAmp 2400
  • PCR tiempo real
    • Light Cycler 480 II
  • Proteómica
    • GelDoc XR
    • ChemiDoc XRS
    • Exquest /spot cutter
  • Cultivo Celular
    • Incubadora CO2
    • Cabina de Bioseguridad Clase II A2
    • Microscopio
    • Microscopio invertido
    • Microscopio de fluorescencia
    • Luminómetro de placas
    • Cámara de hipoxia
    • Tanque criogénico
  • Otros
    • Experion (estación de electroforesis)
    • Bioanalizador 2100
    • NanoDrop 8000
    • Espectrofotómetro Smart Plus
    • Termo-shaker orbital
Publicaciones
  • Enviados: E1. BMC Cancer / # BCAN-D-15-00838 Gene expression signature of TNBC vs nTNBC highlights biomarkers involved in cell metabolism Sandra Karina Santuario-Facio; Servando Cardona-Huerta; Yadira Xitlalli Perez-Paramo; Victor Trevino; Francisco Hernandez-Cabrera; Augusto Rojas-Martinez; Lizeth Martinez-Jacobo; Gerardo Padilla-Rivas; Gerardo Muñoz-Maldonado; Jorge Luis Martinez-Rodriguez; Juan F. Gonzalez-Guerrero; Javier Valero-Gomez; Ana L. Vazquez-Guerrero; Herminia Guadalupe Martinez-Rodriguez; Alvaro Barboza-Quintana; Raquel Garza-Guajardo; Oralia Barboza-Quintana; Rocio Ortiz-Lopez, Ph. D. (corresponding)E2.  Ciencia UANL. Adriana Sánchez-García, Viviana C. Zomosa-Signoret, RocíoOrtiz-López and Román Vidaltamayo. Orexina y sus Aplicaciones en la Clínica.E3: Frontiers in Molecular Neuroscience Adriana Sánchez-García*, Rocío Ortiz-López*,**, Viviana Chantal Zomosa-Signoret*, Román Vidaltamayo***The Transcription Factor ebf2 Activates Gene Expression Driven by a Hypocretin Minimal Promoter Region (Ebf2 increases orexin-promoter driven expression)
  • Publicaciones más recientes
    1. Sevilla González FK, Welsh Lozano O, Ortiz López R, Vera Cabrera L, Ocampo Candiani J, Zamora Avila DE, Ocampo Garza J, Hernández Escareño JJ. “Distribution of Malassezia species in Mexican seborrheic dermatitis patients” ACEPTADO. African Journal of Microbiology Research 2016. ISSN 1996-0808.
    1. Mauricio A. Salinas-Santander1, Elizabeth Bazan-Mendoza2, Marisol Espinosa-Ruiz2, Rocio Ortiz-Lopez3,4, Adriana Bustamante5, Celia Sanchez-Domínguez. The +1858 C/T polymorphism in the PTPN22 gene is associated to Cystic Fibrosis patients in Northeast Mexico. Running title: PTPN22 polymorphism in Mexican patients with CF. ACEPTADO. Archives of Medical Research / # ARCMED-D-16-00145
    1. Antonio Ali Perez-Maya, Rosa Maria Hinojosa-Robles, Jose Ramon Barcenas-Walls, Armando Vignau-Cantu, Hugo A. Barrera-Saldaña, Rocio Ortiz-Lopez. Complete Genome Sequence of Streptococcus pneumoniae Serotype 19A, a Blood Clinical Isolate from Northeast Mexico. ACEPTADO. Genome Announcement March/April 2016 4(2) e00195-16
    1. Cuervo-Sierra J, Jaime-Pérez JC, Martínez-Hernández RA, García-Sepúlveda RD, Sánchez-Cárdenas M, Gómez-Almaguer D, Ortíz-López R, Villarreal-Villarreal CD, Ruiz-Arguelles GJ, Ruiz-Delgado G, LutzPresno J, Garcés-Eisele J, Ignacio-Ibarra G, Muciño-Hernández G, Arana-Trejo RM, Jiménez-Mejia AM, Vásquez-Palacio G. Prevalence and Clinical Significance of FLT3 Mutation Status in Acute Myeloid Leukemia Patients: A Multicenter Study. Arch Med Res. 2016. 47(3):172-9.
    2. Gonzalez-Carrillo C, Millan-Sauceda C, Lozano-Garza HG, Ortiz-Lopez R, Elizondo-Gonzalez R, Welsh O, Ocampo-Candiani J, Vera-Cabrera L. Genomic Changes Associated with the Loss of Nocardia brasiliensis Virulence in Mice after 200 In Vitro Passages. Infect Immun. 2016. 19;84(9):2595-606.
Personal

QCB. Patricia Villarreal Quiroga

QBP. Laura Rivera Narváez

MC. Luis Ernesto Osuna Rosales

TSU. Carlos Alberto Hernández Puente

Juanita González Domínguez

 

M.C. Lizeth Alejandra Martínez Jacobo.

  • Químico Clínico Biólogo, Facultad de Medicina, UANL.
  • Maestría en Ciencias con Orientación en Biología Molecular e Ingeniería Genética, Facultad de Medicina, UANL.
  • Candidato a Doctora en Ciencias con Orientación en Biología Molecular e Ingeniería Genética, Facultad de Medicina, UANL.
  • Certificado en Genética Médica por Universitat de València, València, España
  • Miembro del Colegio Mexicano para el Estudio y Tratamiento de los Defectos Congénitos.
    • Áreas de investigación
      • Análisis multiómico de la alopecia androgenética.
      • Identificación de alteraciones genómicas en pacientes con defectos congénitos y retraso en el desarrollo/discapacidad intelectual de etiología desconocida.
    • Proyectos
      • Identificación de alteraciones genómicas en pacientes con defectos congénitos y retraso en el desarrollo/discapacidad intelectual de etiología desconocida.
      • “Correlación de la expresión de GPR44, PTGDS y PGE2 con el nivel de testosterona total y fracción libre en sangre periférica de pacientes masculinos y femeninos con alopecia androgenética”. M.C.P. César Daniel Villarreal.
      • “Expresión de caspasas y otros genes de apoptosis en pacientes masculinos con alopecia androgenética y su correlación con niveles de testosterona y DHT en sangre periférica”. M.C.P. Ana Cecilia Lamadrid Zertuche.
      • “Efecto de la suplementación dietética con flavonoides durante la gestación y lactancia en ratas Wistar madres y su papel en la prevención de obesidad en la descendencia”. L.N. Carolina Treviño De Alba.

 

IBT. Bianka Dianey Camacho Zamora

  • Ingeniero en Biotecnología, Universidad Politécnica de Sinaloa.
  • Candidata a Maestra en Ciencias con Orientación en Biología Molecular e Ingeniería Genética, Facultad de Medicina, UANL.
    • Áreas de investigación
      • Análisis del papel de FOXC1 en la Transición Epitelial-Mesenquimal en cáncer de mama.
      • Caracterización proteómica de subtipos moleculares de cáncer de mama.
    • Proyectos de Investigación
      • “Papel del factor de transcripción FOXC1 en la Transición Epitelial-Mesenquimal en cáncer de mama”.
      • “Identificación de posibles genes blanco de FOXC1 en líneas celulares de cáncer de mama”. Ana Victoria Camero Maldonado.
      • “Caracterización in vitro de perfiles proteicos de las líneas celulares MCF7 y MCF12A” . José Mauricio Ayala Esparza.
      • “Perfil proteómico comparativo entre las líneas celulares HCC1395 y MDAMB231” Tania Melissa López Pérez.
      • “Uso de la técnica 2D-PAGE para el análisis proteómico comparativo entre las líneas celulares de cáncer de mama BT474 y HCC1954”. Norma Paola Guízar Amador.

 

Estudiantes de Pregrado (Asesoría)

  • José Mauricio Ayala Esparza. Licenciado en Biotecnología Genómica.
  • Norma Paola Guízar Amador. Licenciado en Biotecnología Genómica.
  • Tania Melissa López Pérez. Químico Bacteriólogo Parasitólogo.